清关公司是合法的，它们是专业从事清关业务的企业，具有相应的资质和执照。但是需要注意的是，如果您与清关公司合作，应该确保其是合法的，并且具有相应的经营资质和许可证。同时，您也应该注意保护自己的合法权益，尽量选择正规的清关公司，并与其签署正式合同，明确双方的权利和义务。
在国际贸易中，清关公司扮演着非常重要的角色，帮助企业或个人完成进出口货物的报关、查验、缴税等一系列流程，确保货物顺利进出口，并避免可能出现的违规行为和经济损失。
清关公司需要符合国家法律法规和海关规定，同时需要具备专业的人员、设备和技术，以确保清关业务的准确性和高效性。因此，选择合法的清关公司进行清关操作是非常必要和重要的。